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果醋一般采用水果经发酵工艺而酿造，分为全果发酵、果汁液态发酵等方式，因而过滤设备的选择搭配均不相同，但果醋的澄清过滤大体分为以下几步：
步、除大颗粒或泥状果肉残渣，实现果醋发酵液的初步固液分离；
第二步、初分的滤液中仍然含有部分细小悬浮物、微粒子，因此需进一步微滤；
第三步、微滤液在采用精滤或膜超滤设备，实现果醋的澄清过滤。
传统步过滤多选择板框粗滤进行固液分离，板框一次性投入低，但操作繁琐，滤布等耗材更换量大，且除杂效果对于某些高固含量的果醋全果发酵液分离不够理想。板框后接滤芯或硅藻土等过滤，一次性投入本都虽低，但是滤芯耗材量大，按照产能综合算下来，投入也不算低，硅藻土由于孔径分布不均匀，对果醋中的香气、有效组分进行吸附，对果酒口感影响较大，且容易掉土，污染产品。部分经过硅藻土过滤后果醋只能临时性的澄清，在温度及电荷的影响下，未除去的大分子杂质会团聚析出，即返浑沉淀，导致产品货架期短，严重影响市场销售。
对于产能较小、物料性状较好的物料，选择板框、自然沉降、滤芯等处理也具有很好的优势，但这些只能作为前处理过滤，为保证过滤的稳定性及较长的货架期，需采用先进膜分离超滤技术，即果醋澄清膜过滤系统在分子级对果醋中溶解性的果胶、杂蛋白、酵母自溶物等进行高精度过滤，有效透过果醋营养组分的同时截留除去上述大分子杂质。“诚达过滤”公司设计制造的CD-MZ苹果醋柿子醋果醋错流膜过滤机一次性投入成本较传统过滤设备投入略高，但按照使用寿命、总处理产能、人工劳动强度等综合评估，其投入成本远低于传统设备的投入，且产品品质的稳定，确保了市场竞争力。
典型应用：桑葚醋、苹果醋、柿子醋、刺梨醋、山楂醋、枣醋、木瓜醋、蓝莓醋、蒜醋等果汁类发酵醋。